As atividades de competência da UECI/SEAG são exercidas por uma Comissão Permanente de Controle Interno, diretamente subordinada ao Secretário de Estado da Agricultura, Abastecimento, Aquicultura e Pesca, composta pelos seguintes servidores:

Jailson A. de Boni (Coordenador)

Jonas Coutinho Lisboa 

Célio Louback Rohr

Marcos Frizzera Dias

Rômulo de Alcântara Geraldi

Sérgio Marins Có